Thermo Scientific™ Mass Spectrometry Cleavable Crosslinkers

• Hochgradig reaktive NHS-Ester (an beiden Enden) mit Primäraminen
• MS-spaltbar durch kollisionsinduzierte Dissoziation (CID)
• Hochgradig reine kristalline Reagenzien für Proteinstruktur- und Interaktions-Charakterisierung
• Halb membrangängig, ermöglichen intrazelluläre Vernetzung
• Wasserunlöslich (zuerst in DMF oder DMSO auflösen)

DSSO (Disuccinimidylsulfoxid) und DSBU ((Disuccinimidyl Dibutyric Urea) (oder BuUrBU) sind sowohl MS-spaltbare als auch membran-halbdurchlässige Crosslinker, die an jedem Ende eines Spacerarms aus 7 Kohlenstoffen (DSSO) bzw. Spacerarms aus 11 Atomen (DSBU) einen aminreaktiven N-Hydroxysuccinimid(NHS)-Ester enthalten. Beide Crosslinker haben eine ähnliche Reaktivität wie DSS, enthalten jedoch eine Spaltfunktion in der Linkerregion, die eine Spaltung in der Gasphase durch kollisionsinduzierte Dissoziation (CID) während der Tandem-MS (MS/MS)-Fragmentierung ermöglicht. Die MS-Spaltung von DSSO oder DSBU erzeugt während MS2 diagnostische Ionendubletten, wodurch die Identifizierung vernetzter Peptide von Dead-End Modifikationen unterschieden wird. Die Fragmente vernetzter Peptide werden anschließend mit MeroX oder XlinkX Software identifiziert. Für DSSO ermöglicht die Spaltung vernetzter Peptide MS/MS MS3-Erfassungsverfahren, was die Peptidsequenzierung mit herkömmlichen Datenbanksuchmaschinen zusätzlich erleichtert.

Hinweis: Für eine hochauflösende Analyse der vernetzten Peptide wird für die Quelle Nanospray Flex die LC-Säule Acclaim PepMap 100 C1 empfohlen (Best.- Nr. 164940 oder 164568). Die empfohlene LC-Säule für EASY-Spray ist die EASY-Spray C18 LC-Säule (Kat.- Nr. ES900 oder ES904).