Applied Biosystems™ Protein Thermal Shift™ Software v1.4

Beschreibung

Die Protein Thermal Shift™ Software v1.3 wurde entwickelt, um Proteinschmelzfluoreszenzmesswerte direkt aus Applied Biosystems™ Echtzeit-PCR-Gerätedateien zu analysieren. Verschiedene Proteine haben unterschiedliche Protein Thermal-Shift™ Profile mit jeweils einer einzigartigen Proteinschmelzkurvemform, Steigung, Signal-Rausch-Verhältnis und Temperaturschmelzbereich (siehe Abbildung unten für ein Beispiel). Die Protein Thermal Shift™ Software erzeugt aus diesen Kurven einen oder mehrere Schmelztemperaturwerte (Tm) mit zwei Methoden: den Boltzmann-abgeleiteten Tm und den Ableitungskurven-bestimmten Tm, um als Vergleichspunkte zwischen den Kurven zu dienen und die relative thermische Stabilität des Proteins unter verschiedenen Testbedingungen darzustellen.

>> Laden Sie eine Testversion herunter (Registrierung erforderlich)
>> Laden Sie die Software herunter (Lizenz erforderlich)

Zwei Methoden zur Generierung von Tm-Werten
Die Boltzmann-Methode passt die Daten innerhalb eines automatisch (oder manuell) identifizierten Schmelzbereichs an das zweistufige Boltzmann-Modell an, um den Tm zu erzeugen. Typischerweise wird für Proteine mit einer einzelnen Schmelzdomäne die Boltzmann-Methode verwendet. Für Proteine mit mehreren Schmelzdomänen kann jedoch die Ableitungskurvenmethode verwendet werden. Bei der Ableitungskurvenmethode wird eine numerisch berechnete zweite Ableitung der Rohdaten verwendet, um die Temperaturen zu schätzen, bei denen im Derivatprofil bis zu sechs Peaks (lokale Maxima) auftreten können. Anhand einer empirisch abgeleiteten Schwelle für das Signal-Rausch-Verhältnis wird bestimmt, welche lokalen Maxima erkannt werden.

Kompatibel mit unseren Echtzeit-PCR-Systemen
Die Protein Thermal Shift™ Analysesoftware ist kompatibel mit Ausführungsdateien, die aus diesen Echtzeit-PCR-Systemen generiert werden: QuantStudio™ 3, 5, 6, 7 und 12K Flex, StepOne™, StepOnePlus™, 7500, 7500 Fast und ViiA™7.

Bereiten Sie Ihre Proben mit unseren Protein Thermal Shift™ Kits vor
Bereiten Sie Ihre Proben für die Analyse mit unserem Protein Thermal Shift™ Starter Kit oder Protein Thermal Shift™ Dye Kit (separat erhältlich) vor. Diese Kits enthalten einen Farbstoff, der an exponierte hydrophobe Rückstände bindet, um die thermische Stabilität von Proteinen mit einem Echtzeit-PCR-Instrument zu überwachen, Pufferbedingungen zu identifizieren, die das Protein von Interesse stabilisieren, oder Liganden für Verbindungen zu screenen, die das Protein von Interesse binden.