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Applied Biosystems™ TaqMan™ Copy Number Reference Assay, mouse, Tfrc
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Beschreibung
Mouse TaqMan™ Copy Number Reference Assays are run with predesigned, Custom Plus, and Custom TaqMan™ Copy Number Assays in a duplex, real-time PCR reaction to detect and measure copy number variations in the mouse genome. Mouse TaqMan™ Copy Number Reference Assays are also compatible with the common vector marker and reporter gene predesigned TaqMan™ Copy Number Assays. Two options for genes that can be used as endogenous reference genes in mice are offered: Tfrc and Tert. TaqMan™ Copy Number Reference Assays are designed to unique genomic sequences in the mouse reference genome assembly (NCBI Build 37/mm9) and are required for relative quantitation of copy number targets.
TaqMan™ Copy Number Assays quantitate the gene of interest and normalize to an endogenous reference gene known to be present in two copies in a diploid genome. Please note that TaqMan™ Copy Number Reference Assays are species-specific.
TaqMan™ Kopienzahl-Assays quantifizieren das Gen von Interesse und normieren auf ein endogenes Referenz-Gen, das bekanntermaßen in einem diploiden Genom in zwei Kopien vorliegt.Bitte beachten Sie, dass TaqMan™ Kopienzahl-Referenz-Assays artenspezifisch sind.
TFRC:Die Option für Standard-Referenzgene
TaqMan™ Kopienzahl-Referenz-Assays verfügen über eine VIC™ Farbstoff-markierte TAMRA™ Sonde und Referenzsequenz-spezifische Vorwärts- und Rückwärtsprimer.Die Assays sind nicht Primer-begrenzt.
TaqMan™ Kopienzahl-Referenz-Assay, Maus, TFRC wird als Standard-Referenz-Assay für die Analyse von Kopienzahlen bei Mäusen empfohlen.Dieser Assay weist das Transferrin-Rezeptor-Gen (TFRC) auf Chromosom 16, Zytoband 16qB3 nach.Die Assay-Lokalisierung ist chr.16:32626732 auf NCBI Build 37.Er verfügt über ein 91 bp-Amplikon, das sich innerhalb von Exon 17 des TFRC-Gens befindet.
Der TaqMan™ Kopienzahl-Referenz-Assay, Maus, TERT ist ein alternativer Referenz-Assay. Er wird für den Fall empfohlen, dass der TFRC-Assay aufgrund von Chromosomenaberrationen oder anderen Problemen nur schlecht bei einer Probe funktioniert.Der Assay zielt auf das Telomerase-Reverse-Transkriptase (TERT)-Gen auf Chromosom 13, Zytoband 13qC1 ab.Die Assay-Lokalisierung ist chr.13:73778992 auf NCBI Build 37.Er hat ein 96 bp-Amplikon, das sich innerhalb von Intron 8 des TERT-Gens befindet.
Der einfachste Arbeitsablauf
TaqMan™ Kopienzahl-Assays haben den einfachsten Arbeitsablauf aller derzeit erhältlichen CNV-Analysemethoden.Der Test-Assay (FAM™ Farbstoff-markiert), der Referenz-Assay (VIC™ Farbstoff-markiert), Ihre Proben-DNA und TaqMan™ Master Mix werden kombiniert und laufen dann auf einem Applied Biosystems™ Echtzeit-PCR-System mit dem standardmäßigen TaqMan™ Kopienzahl-Assay-Protokoll.Im Durchschnitt dauert es von der Einrichtung bis zur primären Analyse nur 3 bis 4 Stunden (einschließlich ca. 2 Stunden PCR-Lauf).
Leistungsstarke Datenanalyse-Software
Die CopyCaller™ Software wurde speziell für die Datenanalyse beim TaqMan™ Kopienzahl-Assay entwickelt.Diese kostenlose, anwenderfreundliche Software nutzt eine graphische Benutzeroberfläche, die eine mögliche Kopienanzahl einer Probengruppe schnell und in einem Durchlauf berechnet.Sie gibt außerdem einen Konfidenzwert für jede Kopienzahl und hat eine Ausreißer-Funktion.
Nur für Forschungszwecke.Nicht für therapeutische oder diagnostische Zwecke bei Menschen und Tieren vorgesehen.
Spezifikation
Spezifikation
| 3'-Primer-Modifizierung | Keine |
| 5'-Primer-Modifizierung | Keine |
| Konzentration | 20X |
| Inhalt und Lagerung | Kontroll-Primer-Sondenset(s) |
| Nachweisverfahren | Primer-Sonde |
| Format | Tube |
| GC-Rich PCR Performance | Niedrig |
| PCR-Methode | qPCR |
| Reaktionsgeschwindigkeit | Standard |
| Gensymbol | TFRC |
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Nur für Forschungszwecke. Nicht zur Verwendung bei diagnostischen Verfahren.
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