Thermo Scientific™ CFR9I (XmaI) (10 U/l)

5'...C▵C C G G G...3'

3'...G G G C C▵C...5'

Bedingungen für 100 % Aktivität:

• 1x Puffer Cfr9I:10 mM Tris-HCl (pH 7,2 bei 37°C), 5 mM MgCl₂, 200 mM Natriumglutamat und 0,1 mg/ml BSA
• Bei 37°C inkubieren

Lagerungspuffer:

• Cfr9I wird geliefert in:10 mM Tris-HCl (pH 7,5 bei 25°C), 250 mM KCl, 1 mM DTT, 0,1 mM EDTA, 0,2 mg/ml BSA und 50 % (v/v) Glycerin

Ligation und erneutes Schneiden:

• Nach 50-fachem Verdau mit Cfr9I können über 95 % der DNA-Fragmente ligiert und erneut geschnitten werden

Methylierungseffekte:

• Dam: keine Überlappung – keine Auswirkung
• Dcm: keine Überlappung – keine Auswirkung
• CpG: vollständige Überlappung – Schneiden ist beeinträchtigt.
• EcoKI: keine Überlappung – keine Auswirkung
• EcoBI: keine Überlappung – keine Auswirkung

Verdauung von Agarose-eingebetteter DNA:

• Es sind mindestens 5 U der Enzyme für den vollständigen Verdau von 1 μg in Agarose eingebetteter Lambda-DNA in 16 Stunden erforderlich

Hinweis:

Um mit Cfr9I einen vollständigen Verdauung des Substrats zu erreichen, darf die Konzentration der DNA im Reaktionspuffer nicht unter 50μ g/ml liegen.